Programme
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événement |
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13:30 - 14:00
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Enregistrement - Enregistrement |
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14:00 - 14:30
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2018 highlights and future of France Génomique (Salle Emile Laffon) - Pierre Le Ber |
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14:30 - 15:00
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Bilan et nouveauté : coordination, animation et communication (Salle Emile Laffon) - Mathilde Clément et Marie-Thérèse Bihoreau |
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15:00 - 16:00
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résultats FG (Salle Emile Laffon) |
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| 15:00 - 15:30 |
› Tracking the dynamics of chromatin states in tumor cells: single-cell approaches - Céline Vallot, Dynamique de l'information génétique : bases fondamentales et cancer |
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| 15:30 - 16:00 |
› Single-cell RNA sequencing reveals novel cell differentiation dynamics during human airway epithelium regeneration - Laure-Emmanuelle Zaragosi, Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire |
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16:00 - 16:30
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Pause café (salle Girafe) |
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16:30 - 17:00
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résultats issus des Grands Projets de Séquençage |
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| 16:30 - 17:00 |
› De l'organisme à l'écosystème : la génomique microbienne de l'arsenic. - Philippe Bertin, Génétique Moléculaire, Génomique Microbiologie |
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17:00 - 18:00
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atelier "sequençage et analyse cellules unique" (Salle Emile Laffon) - animé par Laurent journot |
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| 17:00 - 17:10 |
› introduction - Laurent Journot, Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier GenomiX |
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| 17:10 - 17:25 |
› Single cell isoforms sequencing - Kevin Lebrigand, IPMC |
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| 17:25 - 17:40 |
› Comparaison des comptages obtenus en Single Cell entre Celle Ranger et la pipieline Eoulsan - Fanny Coulpier, Institut de biologie de l'école normale supérieure - Laurent JOURDREN, Ecole Normale Supérieure de Paris |
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18:00 - 19:00
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atelier "Epigénétique" (Salle Emile Laffon) - animé par Sophie Chantalat |
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| 18:00 - 18:20 |
› Detection of methylated DNA using Nanopore sequencing - Claude Thermes, Institute for Integrative Biology of the Cell - Delphine Naquin, Institute for Integrative Biology of the Cell |
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19:00 - 19:30
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Enregistrement à l'Hôtel - Enregistrement à l'Hôtel |
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19:30 - 19:30
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Départ pour le dîner - Départ pour le dîner
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20:00 - 22:30
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Dîner (lieu à déterminer) - Dîner
www.chai33.com
Restaurant Chai 33, BERCY VILLAGE, 33 cour Saint-émilion PARIS 12
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vendredi 30 novembre 2018
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événement |
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09:00 - 10:30
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Atelier "haut débit, trés haut débit" (Salle Emile Laffon) - animé par Laurent Journot |
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| 09:00 - 09:05 |
› introduction - Arnaud LEMAINQUE, CEA Paris Saclay |
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| 09:05 - 09:20 |
› How to make long with short? - Marie-Ange Palomares, CNRGH |
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| 09:20 - 09:35 |
› Le Novaseq 6000, moins d'un an après - Aude PERDEREAU, CEA, Genoscope |
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| 09:35 - 09:50 |
› Retour d'expérience sur le NovaSeq - Remy-Félix SERRE, Get-PlaGe - Marine Milhes, Get-PlaGe |
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10:30 - 11:00
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Pause café (salle Girafe) |
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10:45 - 12:00
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session management (salle Potiron ) - Pierre Le Ber |
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11:00 - 12:00
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session poster (Salle Emile Laffon) |
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12:00 - 13:30
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Déjeuner (salle Girafe) |
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13:30 - 15:00
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Atelier "séquençage et analyse longue lecture" (Salle Emile Laffon) - animé par Denis Milan |
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| 13:30 - 13:40 |
› introduction - Denis Milan, Directeur Scientifique GeT |
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| 13:40 - 13:55 |
› Optimisation de protocole de transciptome sur MinIon - Ammara Mohammad, Institut de biologie de l'école normale supérieure - CORINNE BLUGEON, Institut de biologie de l'école normale supérieure |
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| 13:55 - 14:10 |
› Séquençage ADN et ARN avec la technologie ONT - Jean-Marc Aury, Genoscope-Centre national de séquençage |
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| 14:10 - 14:30 |
› What about GeT and Oxford Nanopore Technologies - Maxime Manno, GeT PlaGe, Genotoul - Cécile Donnadieu, GeT PlaGe, Genotoul |
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15:00 - 15:30
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résultats FG (Salle Emile Laffon) |
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| 15:00 - 15:30 |
› Contribution of Oxford NanoPore technology for the de novo genome assembly of non-model species: the case of the Asian ladybird Harmonia axyridis - jacques Lagnel, Unité de recherche Génétique et amélioration des fruits et légumes |
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15:30 - 16:00
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résultats issus des Grands Projets de Séquençage (Salle Emile Laffon) |
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| 15:30 - 16:00 |
› Formes familiales du cancer du sein et gènes de la réparation : résultats du projet de séquençage dans l'étude GENESIS et implications pour les tests génétiques - Fabienne LESUEUR, INSERM U900, Institut Curie, Mines ParisTech, PSL University |
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